稻(dao)属最全超级泛基因组图谱成功绘制(zhi),栽培,鉴定,团队
原标(biao)题：稻(dao)属最全超级泛基因组图谱 成功绘制(zhi)
科技日报讯 （记者魏依晨）记者12月2日得悉，我国工程院院士、江西省农业科学院研究员颜龙安团队联合河北大(da)学教授杜会龙团队成功绘制(zhi)了(le)环(huan)球(qiu)首个稻(dao)属最全超级泛基因组图谱。相关(guan)研究成果在线发表于《自然·通信(xin)》。
该研究组装(zhuang)了(le)稻(dao)属13个近乎完(wan)美的野生稻(dao)种(zhong)基因组，并结合已公开的普通野生稻(dao)、亚洲栽培稻(dao)和非洲栽培稻(dao)基因组，构建了(le)包(bao)含101723个基因家(jia)族的稻(dao)属超级泛基因组。其中，稻(dao)属共(gong)有的焦(jiao)点基因家(jia)族仅占9.84%，共(gong)鉴定到63881个栽培稻(dao)中尚(shang)未发现的新基因家(jia)族，使可(ke)利(li)用的水稻(dao)基因扩大(da)了(le)1.7倍。同(tong)时，基于高质量的基因组图谱，团队首次在基因组水平重构了(le)稻(dao)属的进化关(guan)系。
该研究还从分歧材料中鉴定到2781到10656个插入(ru)序列(lie)、2680到10419个缺(que)失序列(lie)、4到52个易位以及7到22个大(da)倒位等结构变异，首次从基因组变异和等位变异水平解析了(le)野生稻(dao)与栽培稻(dao)的多样性。
在抗病基因方面，团队结合基因组注释和RGAugury等多种(zhong)方法，在稻(dao)属中共(gong)鉴定到7048个抗病基因，其中栽培稻(dao)有237个抗病基因家(jia)族，野生稻(dao)有384个抗病基因家(jia)族。这展现了(le)栽培稻(dao)的抗病基因倾向于成簇存在，而野生稻(dao)的抗病基因则主要以单个形式(shi)存在。
此外，团队还在野生稻(dao)中鉴定到207个串连重复基因，其中36个与产量、抗性、质量、生育期、营养元素(su)高效利(li)用，以及生物(wu)和非生物(wu)胁迫耐受性相关(guan)。
该研究构建的稻(dao)属超级泛基因组极大(da)扩大(da)了(le)水稻(dao)遗传改进的基因池。这对(dui)野生稻(dao)种(zhong)质创新利(li)用具有重要理论(lun)意义和应用价值，同(tong)时为稻(dao)属进化和驯化研究提供了(le)支撑。
泉(quan)源(yuan)：科技日报